taxon	lfc_(Intercept)	lfc_Age_HIV_Shedding_AgeADULT HIV-Pos NON-SHEDDER	se_(Intercept)	se_Age_HIV_Shedding_AgeADULT HIV-Pos NON-SHEDDER	W_(Intercept)	W_Age_HIV_Shedding_AgeADULT HIV-Pos NON-SHEDDER	p_(Intercept)	p_Age_HIV_Shedding_AgeADULT HIV-Pos NON-SHEDDER	q_(Intercept)	q_Age_HIV_Shedding_AgeADULT HIV-Pos NON-SHEDDER	diff_(Intercept)	diff_Age_HIV_Shedding_AgeADULT HIV-Pos NON-SHEDDER	passed_ss_(Intercept)	passed_ss_Age_HIV_Shedding_AgeADULT HIV-Pos NON-SHEDDER
Peptostreptococcaceae_[XI][G-2]	-0.937537002876975	0.897131528827404	0.0150908928446303	0.327222048551213	-62.1260128561957	2.74165977751036	1.68995622995616e-18	0.0159032417317013	1.47026192006186e-16	1	TRUE	FALSE	FALSE	TRUE
Mitsuokella	1.25347799060297	-1.96971017519333	0.262967764603224	0.407670250948042	4.76666025014233	-4.83162597862548	0.000583810036716784	0.000525994541573352	0.0437857527537588	0.047865503283175	TRUE	TRUE	FALSE	TRUE
Lachnospiraceae_[G-8]	-0.580760655673494	0.552479990487066	0.0756934195886252	0.422706917672376	-7.67253823158978	1.30700484754137	3.52295927621656e-06	0.213858334522105	0.000288882660649758	1	TRUE	FALSE	FALSE	TRUE
Shuttleworthia	0.19400075434329	-0.235421749586535	0.429749354587265	0.574431940499266	0.451427680513005	-0.409834016858322	0.656538270815537	0.686284238493215	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Erysipelotrichaceae_[G-1]	0.0992649066899598	-0.302107381487968	0.18708556632174	0.33527949091695	0.530585595893857	-0.901061322485726	0.604651931037601	0.383945321604919	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Parvimonas	-0.635480349635535	1.02193393201595	0.471098318099016	0.642025769203103	-1.34893359882888	1.59173351138911	0.189949143435956	0.124531688053264	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	FALSE
Ruminococcaceae_[G-2]	-0.118597464547751	0.228941432132043	0.438306889427551	0.579011809999773	-0.270580881588799	0.395400280578271	0.789235697803502	0.696355497145121	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Ottowia	-0.351979536889745	0.26106246506881	0.249621309309288	0.445012719199957	-1.41005404491983	0.586640457239396	0.183913440656252	0.568317332417049	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	FALSE
Solobacterium	-0.855812477369001	1.23310121468155	0.136246709156742	0.422141130633737	-6.28134420762008	2.92106389356176	2.07624278771841e-06	0.00768575327369508	0.000172328151380628	0.600183328637871	TRUE	FALSE	TRUE	TRUE
Bulleidia	0.480506165187113	-0.70336855445315	0.13729738398609	0.32600349374512	3.49974741860918	-2.1575491304491	0.00353698308341825	0.0488252926200083	0.247588815839277	1	FALSE	FALSE	FALSE	FALSE
Absconditabacteria_(SR1)_[G-1]	-1.17546299315384	1.7189145546518	0.295361457220971	0.563022954768225	-3.97974402013608	3.0530097220626	0.000737643155951847	0.00627848261892299	0.0538479503844848	0.50227860951384	FALSE	FALSE	FALSE	FALSE
Peptidiphaga	0.764246907193623	-1.01936776515675	0.549713872127038	0.686763303142456	1.39026309129963	-1.48430727223249	0.177757679250244	0.151304040699472	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Eikenella	0.0313208272618697	0.0956911515289581	0.267439297133628	0.435738329135174	0.117113780949776	0.219606918030094	0.907705686513192	0.827960545985209	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Abiotrophia	-0.398843936613464	0.659235203323416	0.566414362369386	0.728739491261733	-0.704155761420045	0.904623958531494	0.488112518464509	0.374656391767146	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Dialister	0.140949326867483	-0.0883871039330627	0.19302967219127	0.412592013266574	0.730195131491591	-0.214223981781141	0.472338936207419	0.832182071717609	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Bacteroidetes_[G-5]	0.469149901685222	-0.743570659710878	0.179688159189895	0.351020579537754	2.6109116137665	-2.11831072893236	0.0215549389243094	0.0539861555035126	1	1	FALSE	FALSE	FALSE	TRUE
Lautropia	1.39902877665721	-1.95587077256405	0.368085667246489	0.563564441367292	3.80082383300285	-3.4705361605477	0.000824827984984717	0.0019007569005321	0.0585627869339149	0.163465093445761	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Ruminococcaceae_[G-1]	-0.524444146823998	0.901388491962432	0.495118925064233	0.609873458041827	-1.05922864240336	1.47799265581519	0.300493456174665	0.152974275855846	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Peptostreptococcaceae_[XI][G-1]	-0.965371023139874	1.49844268263332	0.224776224448213	0.518569397569775	-4.29480931762108	2.8895702092249	0.000249570575938212	0.00805512499482029	0.0189673637713041	0.620244624601162	TRUE	FALSE	TRUE	TRUE
Capnocytophaga	0.0927011558458459	0.00362065865299343	0.290030825453041	0.430982795299982	0.319625183637093	0.00840093547231578	0.751908216776574	0.993363782541719	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Rothia	-0.437908464933948	0.799535089822685	0.297703816879209	0.446096249171956	-1.4709534782741	1.79229278727804	0.153779584680421	0.0851976159615715	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	FALSE
Clostridioides	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1	FALSE	FALSE	FALSE	FALSE
Lachnospiraceae_[G-3]	-0.875064063560949	1.19758878328308	0.313720593808057	0.551949914617886	-2.78931023602594	2.16974176744309	0.0113214222892542	0.042248141905405	0.758535293380028	1	FALSE	FALSE	FALSE	FALSE
Lachnospiraceae_[G-2]	0.378853875896676	-0.522821303842275	0.349328174872352	0.506953463312718	1.08452138461237	-1.03130038884806	0.290428102917908	0.314131998732426	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Fusobacterium	0.145991384659058	-0.0763146845668235	0.203333072886239	0.429021769853933	0.717991336022043	-0.1778806809566	0.479419072774122	0.860250175338693	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Kingella	1.11562698419521	-1.53076808387106	0.293010405213003	0.527144234284849	3.80746541538076	-2.90388850775874	0.000810979403663893	0.00759725732453001	0.0583905170638003	0.600183328637871	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Centipeda	0.74699550988412	-0.990884363977233	0.245793423360576	0.394747737118248	3.03911919070466	-2.51017110626377	0.00647860663264159	0.0207770608007435	0.44702385765227	1	FALSE	FALSE	FALSE	FALSE
Veillonellaceae_[G-1]	-0.387454758331552	0.445646229250216	0.289812270936158	0.448667530725954	-1.33691633235538	0.99326605722761	0.206042896557992	0.340187243878838	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Campylobacter	0.0504916626967535	0.0669348983766321	0.209221835488811	0.328805861759602	0.241330751060416	0.203569662713525	0.811267184768504	0.840337743123211	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Peptostreptococcaceae_[XI][G-5]	-1.12746991048233	1.26751823301699	0.19745584384902	0.472463952506141	-5.70998501996437	2.68278294310828	0.000195605708627167	0.0229826681273495	0.015257245272919	1	TRUE	FALSE	FALSE	FALSE
Johnsonella	-1.56556669227302	1.49957323045358	3.94619211333633e-06	0.302465912550257	-396728.452976763	4.95782555399335	1.82503514627688e-42	0.00110992251041602	1.69728268603749e-40	0.0976731809166101	TRUE	FALSE	FALSE	FALSE
Pseudostreptobacillus	0.60501473350939	-0.837420951261194	0.277917993780998	0.411433283941494	2.17695416291091	-2.03537483219339	0.0723645955368587	0.0880062592034025	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Anaeroglobus	0.264775460422925	-0.268476778978706	0.232709570091015	0.462216258801132	1.13779360393029	-0.580846679160669	0.273054943452198	0.569968686022253	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Peptoniphilaceae_[G-1]	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Filifactor	-0.72243381269438	1.03533585629763	0.166886379857608	0.540815235511036	-4.32889618260507	1.91439846423575	0.000596147986759889	0.0748418313510604	0.0441149510202318	1	TRUE	FALSE	FALSE	TRUE
Peptostreptococcus	-1.84470219067143	2.61625125941016	0.260635991155445	0.434949000326574	-7.07769553427193	6.01507592256976	3.28084240647552e-07	3.91296956759328e-06	2.78871604550419e-05	0.000363906169786175	TRUE	TRUE	TRUE	TRUE
Granulicatella	-0.22428194287722	0.479095306737594	0.269054051891816	0.426006719406436	-0.833594369979613	1.12461913137222	0.412403597017571	0.271432802112574	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Romboutsia	-2.47146068263207	2.5926965974198	3.94619211335259e-06	0.327012492535333	-626290.006071798	7.9284328782628	1.56302250145672e-89	4.12408320869591e-07	1.46924115136932e-87	3.87663821617416e-05	TRUE	TRUE	TRUE	TRUE
Alloprevotella	0.0355919083493235	0.0892845298977777	0.388001023916141	0.586459846081979	0.0917314804741753	0.152243210672086	0.927642480231886	0.880217132639174	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Streptobacillus	-0.559926533159218	0.146538400464416	3.94619211333633e-06	0.291211934220614	-141890.33809756	0.50320190639372	1.48026665452809e-20	0.641268204408039	1.31743732253e-18	1	TRUE	FALSE	FALSE	TRUE
Bacteroidetes_[G-3]	-0.475222544881878	0.305135688093407	0.0763189438779918	0.306385853933722	-6.22679666062463	0.99591963589616	0.000153843623051027	0.345310085686924	0.0121536462210312	1	TRUE	FALSE	FALSE	TRUE
Desulfobulbus	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Bacteroidales_[G-2]	0.343690560642905	-0.517446100656262	0.387768352018897	0.566635281625185	0.886329580156547	-0.9131907550341	0.385973622363107	0.37201990403362	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Mycoplasma	-0.278671348374723	0.254284003046748	0.2336135040709	0.445943253988296	-1.19287345773534	0.570216055008248	0.254236572071279	0.57825360968335	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Prevotella	0.147045784475927	-0.077896284292128	0.335466849032445	0.527499176144642	0.438331790160598	-0.147670911756587	0.664910208944053	0.883787035920275	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Corynebacterium	0.403235629323711	-0.462181051563803	0.449394501274053	0.595943242185106	0.897286522599899	-0.775545419173065	0.378126140103629	0.445292239804093	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Peptostreptococcaceae_[XI][G-9]	-0.584799712236382	0.864985917109635	0.342376510318017	0.46814773357738	-1.70806026293448	1.8476772502983	0.103912401092894	0.0802790940462775	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Leptotrichia	0.47404251808574	-0.568391384706847	0.309624751850014	0.440290966220511	1.53102268230601	-1.29094491668989	0.138320875330727	0.208533457882859	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Pseudoramibacter	1.22958707733707	-1.28874590799421	3.94619211335259e-06	0.289507964363894	311588.24558403	-4.45150416095061	1.26057733801345e-41	0.00213502685927133	1.15973115097237e-39	0.179342256178792	TRUE	FALSE	FALSE	FALSE
Megasphaera	-0.193748441870429	0.433295055227407	0.482417887569533	0.661357485449114	-0.401619522954575	0.65516012861511	0.691376722832508	0.518348238624099	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Atopobium	0.393795206341208	-0.502958965408041	0.202712128590307	0.386026760629338	1.94263268349913	-1.30291217268997	0.0724507955977366	0.213628398997355	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Haemophilus	-0.0724105840038587	0.251288268427551	0.358518722607126	0.514796239718282	-0.201971555285296	0.488131515034115	0.841573481366195	0.629710693674062	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Oribacterium	-0.101643503726493	0.295137648011503	0.232933590275897	0.401516956145111	-0.436362585602626	0.735056498846436	0.666319036284466	0.469144960073034	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Butyrivibrio	-0.307706988732327	0.387164863531776	0.234830593843406	0.427136363890069	-1.31033603286596	0.906419814051281	0.2057025285801	0.3760659121287	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	FALSE
Peptostreptococcaceae_[XI][G-4]	0.0194028446232708	-0.273411652256506	3.94619211337558e-06	0.340082615719242	4916.85251650701	-0.803956567077874	3.03169519539719e-30	0.442138631251467	2.75884262781144e-28	1	TRUE	FALSE	FALSE	FALSE
Catonella	-0.22668342493102	0.477552385414019	0.333869876442707	0.470587643240164	-0.678957405041361	1.01480009573966	0.503660355151542	0.320323053063054	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Peptostreptococcaceae_[XI][G-6]	-2.00698074805507	2.18968353143597	0.203487337935884	0.459810770051934	-9.86292694382506	4.76214058924425	2.34304273842673e-05	0.0020543547365827	0.00189786461812565	0.174620152609529	TRUE	FALSE	FALSE	FALSE
Cardiobacterium	0.261371536556475	-0.277664037173334	0.357827174653088	0.50786601760269	0.730440712922025	-0.546726946772316	0.472191606721908	0.58961394152359	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Bergeyella	-0.162096162790803	0.385816636607968	0.427596360778961	0.643544044486654	-0.379086862422097	0.599518618676253	0.707824069386417	0.554222199538295	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Limosilactobacillus	0.548375940136252	-0.23105335159577	3.94619211332483e-06	0.255054771893583	138963.315618768	-0.905896995693821	1.6089797545267e-20	0.416224011969988	1.4159021839835e-18	1	TRUE	FALSE	FALSE	TRUE
Cryptobacterium	0.17925918089633	-0.354492684735814	0.246430701008405	0.37964115371521	0.727422273940683	-0.933757263317504	0.485458722682391	0.37480205445396	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Stomatobaculum	-0.557028597312131	0.978215288389959	0.389096291191366	0.543416738543243	-1.43159575128968	1.80011990615581	0.164643543615692	0.0839214424585381	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	FALSE
Treponema	0.319248505188225	-0.378370731596887	0.319428850533354	0.574843431641742	0.999435413098008	-0.658215282231316	0.32798327515062	0.51693473549202	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Scardovia	-0.195036512607545	0.614486892038322	0.383146330106206	0.558331523884058	-0.509039229355221	1.10057710473451	0.618130357354305	0.288429573829291	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Peptoanaerobacter_Peptostreptococcaceae_[XI][G-7]	-0.0687811476342281	0.0935028661274432	0.373536412922671	0.563709459992071	-0.184135054186718	0.165870670555641	0.856086102931593	0.870215404750814	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Aggregatibacter	-0.218646676492959	0.4706424071612	0.335000955787559	0.499656559120243	-0.652674784103044	0.941931810101465	0.519923067304189	0.355241334635841	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Lachnoanaerobaculum	-0.378664564538529	0.710669239229556	0.273839871993209	0.412512679704945	-1.38279557970258	1.72278156331551	0.178955416621712	0.0972780516261513	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	FALSE
Atopobium_Lancefieldella	-0.581929109909043	1.01556605728533	0.216287319482405	0.420229392606348	-2.69053734311217	2.41669448913742	0.0125295191685326	0.0232908485342552	0.826948265123152	1	FALSE	FALSE	FALSE	TRUE
Kingella_Neisseria	-0.708572544206015	1.18980765266032	0.409540307838544	0.544854420947162	-1.73016557990517	2.18371661661841	0.0964419111793845	0.0389908648206833	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	FALSE
Leptotrichia_Pseudoleptotrichia	0.227026912479017	-0.220076989746101	0.472009415287029	0.594260171292216	0.480979626944437	-0.370337775233269	0.635750934099469	0.715023899527435	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Moraxella	1.65568253621797	-1.96899027544514	3.94619211337558e-06	0.369771145648627	419564.605231979	-5.32488891741749	1.93622523339253e-22	0.00598581918005101	1.74260271005328e-20	0.490837172764183	TRUE	FALSE	FALSE	FALSE
Porphyromonas	-0.476340953165181	0.857183822169534	0.389717095788028	0.557508396216593	-1.2222736911297	1.53752630092501	0.233003349137163	0.136726083908158	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Centipeda_Selenomonas	0.112752416766996	-0.184850560995172	0.394797827868815	0.499036888554755	0.285595332111254	-0.370414623116364	0.780057950624131	0.717529193186871	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Selenomonas	0.31593616244832	-0.331231851250718	0.263197645662506	0.412157019427452	1.20037609627193	-0.803654519121981	0.241244587632791	0.429172134970166	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Mesocricetibacter_Pasteurella_Rodentibacter	0.0180917240394762	0.0152122507791975	0.134207463469943	0.325544051973911	0.134804157471675	0.0467287013445929	0.894558949249797	0.963345921159752	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Hallella_Prevotella	-1.56976814836675	2.00845312726444	0.175594727287241	0.433040369616263	-8.9397225794764	4.63802746391571	1.18522267526555e-06	0.000572125954045978	9.95587047223061e-05	0.051491335864138	TRUE	FALSE	FALSE	FALSE
Morococcus_Neisseria	-0.0643348997665495	0.239174742071587	0.391941211793104	0.535310957153224	-0.164144258962261	0.44679590222385	0.870937469821178	0.658869071725744	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Gemella	-0.390628856719848	0.728615677501535	0.31046774309068	0.481469455379322	-1.25819466084036	1.51331651335493	0.219945977904008	0.142739848042993	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Parvimonas_Peptostreptococcus	-1.65346501915484	2.53394626861398	0.360752206968262	0.518453311627129	-4.5833815766519	4.88751100974043	0.000230521914617611	0.000118504625216351	0.0177501874255561	0.0109024255199043	TRUE	TRUE	FALSE	FALSE
Mogibacterium	-0.997364123680956	1.6387185779432	0.219352908692086	0.439626108103321	-4.54684704035993	3.7275278873066	0.000120615609719455	0.000993962426652652	0.00964924877755638	0.088462655972086	TRUE	FALSE	TRUE	TRUE
Neisseria	-0.841230253479178	1.40451777264053	0.337705803010189	0.468991863785868	-2.49101509651523	2.99475935744975	0.0197369886642144	0.00611466690998813	1	0.495288019709039	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Eikenella_Neisseria	0.166272476326529	-0.117085977397698	0.189620534371183	0.437182307035216	0.876869569416198	-0.267819569807674	0.392780599433289	0.792060609049422	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Escherichia_Pseudescherichia_Shigella	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1	FALSE	FALSE	FALSE	FALSE
Tannerella	-0.0209174107758042	0.154071999923094	0.339484616163453	0.516982535619686	-0.061615194856821	0.298021672508558	0.951379531705033	0.768251389147216	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Veillonella	-0.14485821601881	0.359959716449978	0.260366241268221	0.443342784428984	-0.556363280098136	0.81192190127465	0.582908769723816	0.424500217206613	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Fretibacterium	-1.15162240235845	1.28701562764297	0.11689033474736	0.325903935210155	-9.85216104349006	3.94906439780502	2.13807047134417e-07	0.00166447691485551	1.83874060535599e-05	0.144809491592429	TRUE	FALSE	FALSE	FALSE
Streptococcus	-0.362799500667175	0.686871643422526	0.533712169162714	0.637052565211003	-0.679766214130612	1.07820246072633	0.502898868527727	0.291237288055882	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Actinomyces	0.189955854575883	-0.142261389442061	0.413017347915298	0.571579694350614	0.459922217637306	-0.24889160837613	0.649547011477472	0.805478010123481	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Peptococcus	0.598016864077484	-0.837379282567046	0.200925810698972	0.393608322446205	2.97630683682265	-2.1274430310896	0.00775788170957613	0.0466991906289994	0.527535956251177	1	FALSE	FALSE	FALSE	FALSE
Bacteroidaceae_[G-1]_Phocaeicola	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	FALSE
Eikenella_Kingella	0.586334097347835	-0.792489869743184	0.247958694069443	0.429838653641532	2.36464423862318	-1.84369149453946	0.0310229643028986	0.0838288837460754	1	1	FALSE	FALSE	FALSE	TRUE
Bifidobacterium	-0.616728265439646	0.581522616760773	0.305662750665102	0.450487477861252	-2.0176755724984	1.29087409825824	0.113798750643811	0.26630241733723	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Schaalia	-1.14215645879592	1.85590708061565	0.444901518864456	0.572944844207527	-2.56721186682191	3.23924213539727	0.016620085536925	0.00337469081520931	1	0.280099337662373	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Kocuria	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1	FALSE	FALSE	FALSE	FALSE
